Rok 2065. Ziemi zagrażają przybysze z kosmosu. Siłami dobra kierują piękna i niezwykle błyskotliwa Aki Ross i jej mentor dr Sid, którzy opracowują bardzo skomplikowaną i niesprawdzoną jeszcze metodę neutralizacji kosmitów. Nie ma czasu do stracenia, tym bardziej, że Aki odkrywa, że sama została zainfekowana przez przybyszów z obcej planety.